В Академгородке весь сентябрь и октябрь проходят акции протеста против вырубки естественных лесов под строительство элитного жилья и будущего Технопарка. Возмущение людей вызвано тем, что уничтожаются оставшиеся небольшие лесные участки в центральной зоне Академгородка, хотя неподалеку есть открытые незастроенные территории, достаточные для размещения всех планируемых застроек.
Вырубки, по утверждению заявителей в суд, начинаются внезапно, без широкого обсуждения с общественностью, что предусмотрено решением Новосибирского городского совета.
Пикетирование на местах вырубки порой доходят до рукопашных схваток с охраной, нанятой застройщиками. Во время пикетов проводится сбор подписей в защиту лесов. 8 октября состоялся митинг протеста против произвола властей (количество участников – более 300). В принятой резолюции действия президиума СО РАН, мэрии Новосибирска и администрации области в отношении Академгородка квалифицируются как "беспрецедентный вандализм, уничтожение научного потенциала и культурного наследия России". Резолюция митинга и пять тысяч собранных подписей направлены президенту России, полномочному представителю президента по Сибирскому федеральному округу, в Президиум РАН, а также в Общественную палату России.
По сообщениям местной прессы, заказчиком внесены изменения в проект застройки, уменьшающие площадь осваиваемого (вырубаемого) лесного массива на 60 тыс. кв. м. Активисты Академгородка воспринимают это как свою победу.